El proyecto que crea el Servicio de Biodiversidad y Áreas Protegidas (SBAP) busca establecer un servicio público, dependiente del Ministerio del Medio Ambiente, que se encargue de la conservación de la biodiversidad.
El nuevo santuario ubicado en el norte del país es una de las principales áreas de nidificación del gaviotín chico. El ubicado en Chiloé, en tanto, es considerado como uno de los diez humedales costeros más importantes para las aves migratorias de Chile.
Se trata de las especies de ave rayadito de Masafuera, aguilucho de Masafuera o blindado, churrete de Masafuera, picaflor de Juan Fernández, cachudito de Juan Fernández y el cernícalo de Juan Fernandez.
El nuevo Santuario de la Naturaleza, que corresponde al humedal costero Lagos Huillinco y Cucao, comprende una superficie de 3.030,6 hectáreas y es parte de la comuna de Chonchi.